Protein–RNA interactions for Protein: P07949

RET, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETP07949 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RETP07949 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RETP07949 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RETP07949 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RETP07949 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RETP07949 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RETP07949 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RETP07949 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RETP07949 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RETP07949 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RETP07949 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RETP07949 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RETP07949 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RETP07949 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RETP07949 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RETP07949 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RETP07949 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RETP07949 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RETP07949 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
RETP07949 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RETP07949 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RETP07949 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RETP07949 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RETP07949 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RETP07949 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RETP07949 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RETP07949 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RETP07949 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RETP07949 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RETP07949 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RETP07949 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RETP07949 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RETP07949 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RETP07949 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RETP07949 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RETP07949 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RETP07949 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RETP07949 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RETP07949 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RETP07949 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RETP07949 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RETP07949 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RETP07949 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RETP07949 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RETP07949 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RETP07949 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RETP07949 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RETP07949 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RETP07949 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RETP07949 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RETP07949 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RETP07949 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RETP07949 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RETP07949 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RETP07949 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RETP07949 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RETP07949 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETP07949 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETP07949 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETP07949 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETP07949 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETP07949 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETP07949 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETP07949 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETP07949 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETP07949 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETP07949 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETP07949 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETP07949 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETP07949 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETP07949 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RETP07949 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RETP07949 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RETP07949 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RETP07949 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RETP07949 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RETP07949 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RETP07949 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RETP07949 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RETP07949 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETP07949 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETP07949 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETP07949 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETP07949 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETP07949 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RETP07949 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RETP07949 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RETP07949 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RETP07949 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RETP07949 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RETP07949 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RETP07949 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RETP07949 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RETP07949 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RETP07949 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RETP07949 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RETP07949 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RETP07949 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RETP07949 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RETP07949 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms