Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NEFLP07196 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NEFLP07196 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
NEFLP07196 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEFLP07196 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEFLP07196 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEFLP07196 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEFLP07196 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEFLP07196 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
NEFLP07196 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
NEFLP07196 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
NEFLP07196 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NEFLP07196 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
NEFLP07196 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NEFLP07196 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NEFLP07196 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
NEFLP07196 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
NEFLP07196 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
NEFLP07196 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
NEFLP07196 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NEFLP07196 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NEFLP07196 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NEFLP07196 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NEFLP07196 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
NEFLP07196 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
NEFLP07196 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEFLP07196 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEFLP07196 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEFLP07196 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEFLP07196 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEFLP07196 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEFLP07196 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEFLP07196 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEFLP07196 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEFLP07196 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
NEFLP07196 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NEFLP07196 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NEFLP07196 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NEFLP07196 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NEFLP07196 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NEFLP07196 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NEFLP07196 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NEFLP07196 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
NEFLP07196 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
NEFLP07196 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
NEFLP07196 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
NEFLP07196 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NEFLP07196 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NEFLP07196 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
NEFLP07196 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEFLP07196 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEFLP07196 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEFLP07196 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEFLP07196 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEFLP07196 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEFLP07196 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
NEFLP07196 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
NEFLP07196 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEFLP07196 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEFLP07196 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEFLP07196 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEFLP07196 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEFLP07196 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEFLP07196 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEFLP07196 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
NEFLP07196 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NEFLP07196 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
NEFLP07196 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NEFLP07196 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NEFLP07196 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
NEFLP07196 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
NEFLP07196 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NEFLP07196 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NEFLP07196 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
NEFLP07196 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NEFLP07196 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NEFLP07196 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
NEFLP07196 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NEFLP07196 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
NEFLP07196 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NEFLP07196 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
NEFLP07196 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NEFLP07196 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
NEFLP07196 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NEFLP07196 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
NEFLP07196 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NEFLP07196 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
NEFLP07196 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
NEFLP07196 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
NEFLP07196 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NEFLP07196 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NEFLP07196 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
NEFLP07196 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
NEFLP07196 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NEFLP07196 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NEFLP07196 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
NEFLP07196 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NEFLP07196 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
NEFLP07196 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NEFLP07196 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms