Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PRM2P04554 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRM2P04554 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRM2P04554 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRM2P04554 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
PRM2P04554 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRM2P04554 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRM2P04554 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRM2P04554 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRM2P04554 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
PRM2P04554 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRM2P04554 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRM2P04554 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRM2P04554 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRM2P04554 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRM2P04554 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PRM2P04554 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRM2P04554 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRM2P04554 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
PRM2P04554 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRM2P04554 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PRM2P04554 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRM2P04554 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRM2P04554 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
PRM2P04554 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRM2P04554 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRM2P04554 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRM2P04554 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRM2P04554 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRM2P04554 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRM2P04554 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PRM2P04554 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRM2P04554 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRM2P04554 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRM2P04554 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRM2P04554 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRM2P04554 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRM2P04554 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
PRM2P04554 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRM2P04554 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PRM2P04554 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM2P04554 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM2P04554 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM2P04554 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM2P04554 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM2P04554 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM2P04554 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM2P04554 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM2P04554 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PRM2P04554 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM2P04554 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM2P04554 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM2P04554 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM2P04554 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM2P04554 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM2P04554 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM2P04554 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM2P04554 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM2P04554 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM2P04554 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PRM2P04554 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRM2P04554 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRM2P04554 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRM2P04554 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRM2P04554 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRM2P04554 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PRM2P04554 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRM2P04554 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRM2P04554 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PRM2P04554 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRM2P04554 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PRM2P04554 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRM2P04554 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRM2P04554 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRM2P04554 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRM2P04554 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRM2P04554 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRM2P04554 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRM2P04554 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PRM2P04554 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRM2P04554 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRM2P04554 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRM2P04554 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PRM2P04554 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRM2P04554 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRM2P04554 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRM2P04554 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PRM2P04554 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PRM2P04554 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRM2P04554 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRM2P04554 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PRM2P04554 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRM2P04554 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRM2P04554 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRM2P04554 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRM2P04554 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRM2P04554 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRM2P04554 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRM2P04554 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PRM2P04554 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms