Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYCNP04198 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYCNP04198 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MYCNP04198 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYCNP04198 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYCNP04198 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYCNP04198 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYCNP04198 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MYCNP04198 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYCNP04198 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYCNP04198 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYCNP04198 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYCNP04198 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYCNP04198 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYCNP04198 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MYCNP04198 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYCNP04198 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYCNP04198 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYCNP04198 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYCNP04198 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYCNP04198 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MYCNP04198 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYCNP04198 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYCNP04198 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYCNP04198 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYCNP04198 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MYCNP04198 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MYCNP04198 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYCNP04198 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYCNP04198 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MYCNP04198 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYCNP04198 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYCNP04198 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYCNP04198 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MYCNP04198 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MYCNP04198 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYCNP04198 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYCNP04198 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYCNP04198 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MYCNP04198 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYCNP04198 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYCNP04198 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MYCNP04198 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYCNP04198 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYCNP04198 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYCNP04198 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYCNP04198 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYCNP04198 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYCNP04198 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYCNP04198 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYCNP04198 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYCNP04198 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYCNP04198 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYCNP04198 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYCNP04198 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYCNP04198 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYCNP04198 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYCNP04198 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYCNP04198 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYCNP04198 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYCNP04198 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYCNP04198 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MYCNP04198 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYCNP04198 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYCNP04198 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MYCNP04198 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYCNP04198 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYCNP04198 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYCNP04198 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYCNP04198 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYCNP04198 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYCNP04198 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYCNP04198 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MYCNP04198 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYCNP04198 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYCNP04198 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYCNP04198 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MYCNP04198 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYCNP04198 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYCNP04198 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYCNP04198 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYCNP04198 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYCNP04198 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYCNP04198 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYCNP04198 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYCNP04198 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYCNP04198 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MYCNP04198 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYCNP04198 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYCNP04198 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYCNP04198 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYCNP04198 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MYCNP04198 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYCNP04198 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYCNP04198 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYCNP04198 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYCNP04198 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYCNP04198 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYCNP04198 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYCNP04198 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.3 ms