Protein–RNA interactions for Protein: P02766

TTR, Transthyretin, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTRP02766 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTRP02766 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTRP02766 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTRP02766 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
TTRP02766 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
TTRP02766 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTRP02766 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTRP02766 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTRP02766 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTRP02766 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTRP02766 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
TTRP02766 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TTRP02766 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTRP02766 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTRP02766 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TTRP02766 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTRP02766 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTRP02766 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTRP02766 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTRP02766 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTRP02766 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTRP02766 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TTRP02766 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTRP02766 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTRP02766 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTRP02766 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTRP02766 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTRP02766 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTRP02766 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TTRP02766 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTRP02766 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTRP02766 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTRP02766 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTRP02766 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTRP02766 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTRP02766 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTRP02766 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTRP02766 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTRP02766 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTRP02766 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTRP02766 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TTRP02766 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTRP02766 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTRP02766 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TTRP02766 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
TTRP02766 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTRP02766 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTRP02766 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
TTRP02766 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTRP02766 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTRP02766 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTRP02766 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTRP02766 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTRP02766 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTRP02766 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTRP02766 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
TTRP02766 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
TTRP02766 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTRP02766 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTRP02766 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTRP02766 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTRP02766 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTRP02766 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
TTRP02766 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
TTRP02766 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TTRP02766 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
TTRP02766 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TTRP02766 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
TTRP02766 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTRP02766 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTRP02766 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTRP02766 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTRP02766 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTRP02766 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTRP02766 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTRP02766 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTRP02766 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTRP02766 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTRP02766 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTRP02766 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTRP02766 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTRP02766 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTRP02766 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTRP02766 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTRP02766 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
TTRP02766 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTRP02766 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTRP02766 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTRP02766 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTRP02766 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTRP02766 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTRP02766 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTRP02766 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TTRP02766 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TTRP02766 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTRP02766 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTRP02766 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTRP02766 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TTRP02766 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TTRP02766 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms