Protein–RNA interactions for Protein: O95989

NUDT3, Diphosphoinositol polyphosphate phosphohydrolase 1, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDT3O95989 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUDT3O95989 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUDT3O95989 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUDT3O95989 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NUDT3O95989 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NUDT3O95989 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUDT3O95989 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NUDT3O95989 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUDT3O95989 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUDT3O95989 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUDT3O95989 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUDT3O95989 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUDT3O95989 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUDT3O95989 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NUDT3O95989 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUDT3O95989 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUDT3O95989 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUDT3O95989 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUDT3O95989 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUDT3O95989 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUDT3O95989 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NUDT3O95989 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUDT3O95989 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUDT3O95989 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUDT3O95989 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUDT3O95989 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NUDT3O95989 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUDT3O95989 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUDT3O95989 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUDT3O95989 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NUDT3O95989 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms