Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SYNGR4O95473 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SYNGR4O95473 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms