Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SVILO95425 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SVILO95425 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SVILO95425 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SVILO95425 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SVILO95425 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SVILO95425 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SVILO95425 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SVILO95425 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SVILO95425 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SVILO95425 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SVILO95425 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SVILO95425 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SVILO95425 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SVILO95425 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SVILO95425 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SVILO95425 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SVILO95425 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SVILO95425 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SVILO95425 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SVILO95425 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SVILO95425 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SVILO95425 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SVILO95425 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SVILO95425 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SVILO95425 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SVILO95425 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SVILO95425 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SVILO95425 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SVILO95425 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SVILO95425 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SVILO95425 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SVILO95425 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SVILO95425 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SVILO95425 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SVILO95425 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SVILO95425 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SVILO95425 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SVILO95425 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SVILO95425 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SVILO95425 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SVILO95425 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SVILO95425 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SVILO95425 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SVILO95425 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SVILO95425 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SVILO95425 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SVILO95425 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SVILO95425 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SVILO95425 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SVILO95425 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SVILO95425 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SVILO95425 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SVILO95425 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SVILO95425 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SVILO95425 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SVILO95425 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SVILO95425 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SVILO95425 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SVILO95425 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SVILO95425 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SVILO95425 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SVILO95425 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SVILO95425 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SVILO95425 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SVILO95425 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SVILO95425 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SVILO95425 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SVILO95425 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SVILO95425 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SVILO95425 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SVILO95425 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SVILO95425 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SVILO95425 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SVILO95425 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SVILO95425 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SVILO95425 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SVILO95425 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SVILO95425 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SVILO95425 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SVILO95425 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SVILO95425 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SVILO95425 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SVILO95425 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SVILO95425 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SVILO95425 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SVILO95425 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SVILO95425 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SVILO95425 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SVILO95425 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SVILO95425 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SVILO95425 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SVILO95425 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SVILO95425 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SVILO95425 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SVILO95425 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SVILO95425 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SVILO95425 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SVILO95425 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SVILO95425 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms