Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZIC2O95409 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZIC2O95409 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZIC2O95409 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms