Protein–RNA interactions for Protein: O95206

PCDH8, Protocadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH8O95206 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCDH8O95206 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PCDH8O95206 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PCDH8O95206 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH8O95206 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH8O95206 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH8O95206 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PCDH8O95206 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH8O95206 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH8O95206 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH8O95206 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH8O95206 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH8O95206 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PCDH8O95206 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms