Protein–RNA interactions for Protein: O95096

NKX2-2, Homeobox protein Nkx-2.2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-2O95096 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NKX2-2O95096 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NKX2-2O95096 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NKX2-2O95096 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.6 ms