Protein–RNA interactions for Protein: O94985

CLSTN1, Calsyntenin-1, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN1O94985 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLSTN1O94985 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CLSTN1O94985 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLSTN1O94985 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms