Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIG2O94898 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LRIG2O94898 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRIG2O94898 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRIG2O94898 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms