Protein–RNA interactions for Protein: O76070

SNCG, Gamma-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCGO76070 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCGO76070 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SNCGO76070 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNCGO76070 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNCGO76070 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNCGO76070 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNCGO76070 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNCGO76070 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNCGO76070 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SNCGO76070 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNCGO76070 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNCGO76070 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNCGO76070 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNCGO76070 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNCGO76070 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNCGO76070 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNCGO76070 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SNCGO76070 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNCGO76070 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNCGO76070 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNCGO76070 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNCGO76070 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNCGO76070 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNCGO76070 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNCGO76070 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNCGO76070 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNCGO76070 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNCGO76070 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SNCGO76070 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNCGO76070 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNCGO76070 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNCGO76070 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNCGO76070 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNCGO76070 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNCGO76070 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SNCGO76070 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SNCGO76070 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCGO76070 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCGO76070 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCGO76070 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCGO76070 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCGO76070 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCGO76070 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCGO76070 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCGO76070 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCGO76070 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCGO76070 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SNCGO76070 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNCGO76070 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SNCGO76070 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCGO76070 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCGO76070 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCGO76070 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCGO76070 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCGO76070 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCGO76070 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCGO76070 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCGO76070 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNCGO76070 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCGO76070 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCGO76070 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCGO76070 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCGO76070 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCGO76070 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCGO76070 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCGO76070 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCGO76070 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCGO76070 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCGO76070 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNCGO76070 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCGO76070 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCGO76070 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCGO76070 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCGO76070 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCGO76070 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCGO76070 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCGO76070 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNCGO76070 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCGO76070 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCGO76070 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCGO76070 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCGO76070 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCGO76070 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCGO76070 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCGO76070 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCGO76070 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCGO76070 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCGO76070 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNCGO76070 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCGO76070 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCGO76070 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCGO76070 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCGO76070 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCGO76070 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCGO76070 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCGO76070 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNCGO76070 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCGO76070 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCGO76070 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SNCGO76070 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms