Protein–RNA interactions for Protein: O75901

RASSF9, Ras association domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF9O75901 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RASSF9O75901 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RASSF9O75901 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RASSF9O75901 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RASSF9O75901 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms