Protein–RNA interactions for Protein: O75818

RPP40, Ribonuclease P protein subunit p40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPP40O75818 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPP40O75818 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPP40O75818 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPP40O75818 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPP40O75818 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPP40O75818 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPP40O75818 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPP40O75818 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPP40O75818 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPP40O75818 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPP40O75818 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RPP40O75818 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPP40O75818 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPP40O75818 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPP40O75818 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPP40O75818 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPP40O75818 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RPP40O75818 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPP40O75818 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPP40O75818 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RPP40O75818 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPP40O75818 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPP40O75818 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RPP40O75818 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPP40O75818 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPP40O75818 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPP40O75818 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RPP40O75818 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPP40O75818 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPP40O75818 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPP40O75818 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPP40O75818 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPP40O75818 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPP40O75818 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RPP40O75818 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPP40O75818 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPP40O75818 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPP40O75818 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RPP40O75818 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RPP40O75818 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPP40O75818 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPP40O75818 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPP40O75818 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPP40O75818 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPP40O75818 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPP40O75818 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPP40O75818 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RPP40O75818 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPP40O75818 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RPP40O75818 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPP40O75818 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPP40O75818 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPP40O75818 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RPP40O75818 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPP40O75818 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPP40O75818 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPP40O75818 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPP40O75818 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RPP40O75818 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPP40O75818 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPP40O75818 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPP40O75818 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPP40O75818 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPP40O75818 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPP40O75818 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RPP40O75818 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPP40O75818 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPP40O75818 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPP40O75818 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RPP40O75818 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPP40O75818 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RPP40O75818 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPP40O75818 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPP40O75818 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPP40O75818 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPP40O75818 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
RPP40O75818 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPP40O75818 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPP40O75818 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RPP40O75818 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPP40O75818 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPP40O75818 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPP40O75818 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RPP40O75818 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPP40O75818 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPP40O75818 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPP40O75818 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPP40O75818 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RPP40O75818 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPP40O75818 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPP40O75818 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPP40O75818 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPP40O75818 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPP40O75818 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPP40O75818 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPP40O75818 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RPP40O75818 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RPP40O75818 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPP40O75818 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RPP40O75818 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms