Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPM3O75607 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NPM3O75607 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NPM3O75607 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NPM3O75607 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NPM3O75607 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NPM3O75607 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NPM3O75607 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NPM3O75607 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NPM3O75607 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NPM3O75607 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPM3O75607 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPM3O75607 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NPM3O75607 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NPM3O75607 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NPM3O75607 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NPM3O75607 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NPM3O75607 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NPM3O75607 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NPM3O75607 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPM3O75607 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPM3O75607 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPM3O75607 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPM3O75607 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPM3O75607 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NPM3O75607 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPM3O75607 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPM3O75607 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NPM3O75607 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPM3O75607 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPM3O75607 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NPM3O75607 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPM3O75607 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NPM3O75607 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NPM3O75607 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NPM3O75607 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NPM3O75607 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NPM3O75607 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NPM3O75607 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NPM3O75607 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NPM3O75607 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NPM3O75607 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NPM3O75607 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NPM3O75607 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPM3O75607 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPM3O75607 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPM3O75607 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NPM3O75607 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
NPM3O75607 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NPM3O75607 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NPM3O75607 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
NPM3O75607 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
NPM3O75607 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
NPM3O75607 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPM3O75607 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPM3O75607 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPM3O75607 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPM3O75607 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPM3O75607 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
NPM3O75607 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
NPM3O75607 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
NPM3O75607 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPM3O75607 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPM3O75607 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPM3O75607 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPM3O75607 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPM3O75607 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPM3O75607 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
NPM3O75607 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPM3O75607 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPM3O75607 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
NPM3O75607 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPM3O75607 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPM3O75607 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
NPM3O75607 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPM3O75607 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPM3O75607 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPM3O75607 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPM3O75607 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
NPM3O75607 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPM3O75607 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPM3O75607 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NPM3O75607 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NPM3O75607 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
NPM3O75607 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPM3O75607 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPM3O75607 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPM3O75607 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
NPM3O75607 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPM3O75607 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPM3O75607 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPM3O75607 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPM3O75607 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPM3O75607 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NPM3O75607 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPM3O75607 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPM3O75607 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPM3O75607 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPM3O75607 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NPM3O75607 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms