Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC4O75487 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC4O75487 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC4O75487 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC4O75487 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC4O75487 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC4O75487 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC4O75487 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC4O75487 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC4O75487 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC4O75487 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC4O75487 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC4O75487 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC4O75487 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC4O75487 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC4O75487 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC4O75487 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPC4O75487 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPC4O75487 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPC4O75487 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPC4O75487 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPC4O75487 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPC4O75487 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPC4O75487 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPC4O75487 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC4O75487 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC4O75487 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC4O75487 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC4O75487 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC4O75487 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC4O75487 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC4O75487 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC4O75487 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC4O75487 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC4O75487 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC4O75487 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC4O75487 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC4O75487 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC4O75487 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC4O75487 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC4O75487 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC4O75487 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC4O75487 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC4O75487 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC4O75487 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC4O75487 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC4O75487 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC4O75487 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC4O75487 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC4O75487 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC4O75487 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC4O75487 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC4O75487 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC4O75487 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC4O75487 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC4O75487 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC4O75487 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC4O75487 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC4O75487 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC4O75487 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC4O75487 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC4O75487 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC4O75487 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC4O75487 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GPC4O75487 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC4O75487 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC4O75487 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC4O75487 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC4O75487 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC4O75487 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC4O75487 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC4O75487 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC4O75487 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC4O75487 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPC4O75487 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPC4O75487 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPC4O75487 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPC4O75487 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPC4O75487 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPC4O75487 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPC4O75487 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GPC4O75487 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPC4O75487 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPC4O75487 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPC4O75487 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC4O75487 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC4O75487 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC4O75487 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPC4O75487 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPC4O75487 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPC4O75487 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPC4O75487 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPC4O75487 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPC4O75487 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPC4O75487 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPC4O75487 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPC4O75487 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GPC4O75487 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GPC4O75487 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPC4O75487 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms