Protein–RNA interactions for Protein: O75449

KATNA1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNA1O75449 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KATNA1O75449 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
KATNA1O75449 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KATNA1O75449 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.8 ms