Protein–RNA interactions for Protein: O75364

PITX3, Pituitary homeobox 3, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3O75364 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX3O75364 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PITX3O75364 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX3O75364 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX3O75364 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX3O75364 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX3O75364 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX3O75364 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX3O75364 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX3O75364 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX3O75364 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PITX3O75364 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX3O75364 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX3O75364 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX3O75364 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX3O75364 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX3O75364 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX3O75364 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX3O75364 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PITX3O75364 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX3O75364 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX3O75364 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX3O75364 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX3O75364 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX3O75364 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX3O75364 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX3O75364 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX3O75364 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX3O75364 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX3O75364 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PITX3O75364 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX3O75364 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX3O75364 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX3O75364 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX3O75364 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX3O75364 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX3O75364 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX3O75364 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PITX3O75364 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITX3O75364 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITX3O75364 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITX3O75364 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITX3O75364 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITX3O75364 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PITX3O75364 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PITX3O75364 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PITX3O75364 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX3O75364 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX3O75364 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX3O75364 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX3O75364 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX3O75364 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX3O75364 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX3O75364 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX3O75364 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX3O75364 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX3O75364 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX3O75364 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX3O75364 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PITX3O75364 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PITX3O75364 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITX3O75364 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITX3O75364 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITX3O75364 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITX3O75364 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PITX3O75364 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITX3O75364 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PITX3O75364 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITX3O75364 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITX3O75364 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITX3O75364 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PITX3O75364 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX3O75364 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX3O75364 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX3O75364 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX3O75364 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX3O75364 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX3O75364 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX3O75364 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX3O75364 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX3O75364 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX3O75364 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PITX3O75364 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX3O75364 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX3O75364 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX3O75364 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX3O75364 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX3O75364 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX3O75364 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX3O75364 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX3O75364 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX3O75364 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PITX3O75364 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PITX3O75364 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PITX3O75364 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITX3O75364 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITX3O75364 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITX3O75364 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITX3O75364 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PITX3O75364 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms