Protein–RNA interactions for Protein: O60716

CTNND1, Catenin delta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND1O60716 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTNND1O60716 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CTNND1O60716 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTNND1O60716 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTNND1O60716 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTNND1O60716 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTNND1O60716 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTNND1O60716 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTNND1O60716 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTNND1O60716 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTNND1O60716 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTNND1O60716 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CTNND1O60716 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTNND1O60716 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CTNND1O60716 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTNND1O60716 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTNND1O60716 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CTNND1O60716 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTNND1O60716 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTNND1O60716 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTNND1O60716 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CTNND1O60716 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTNND1O60716 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTNND1O60716 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTNND1O60716 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTNND1O60716 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTNND1O60716 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTNND1O60716 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CTNND1O60716 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTNND1O60716 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CTNND1O60716 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNND1O60716 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNND1O60716 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNND1O60716 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTNND1O60716 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms