Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOXD2O60548 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FOXD2O60548 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FOXD2O60548 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FOXD2O60548 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms