Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
KIAA0556O60303 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
KIAA0556O60303 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
KIAA0556O60303 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC38.75■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC38.72■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC38.72■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC38.71■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
KIAA0556O60303 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
KIAA0556O60303 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
KIAA0556O60303 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
KIAA0556O60303 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
KIAA0556O60303 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC38.68■■■■□ 3.78
KIAA0556O60303 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
KIAA0556O60303 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
KIAA0556O60303 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
KIAA0556O60303 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
KIAA0556O60303 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
KIAA0556O60303 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
KIAA0556O60303 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
KIAA0556O60303 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
KIAA0556O60303 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
KIAA0556O60303 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
KIAA0556O60303 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC38.64■■■■□ 3.78
KIAA0556O60303 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC38.64■■■■□ 3.78
KIAA0556O60303 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
KIAA0556O60303 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC38.61■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC38.59■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC38.58■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC38.57■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC38.57■■■■□ 3.77
KIAA0556O60303 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.56■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC38.56■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.54■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC38.54■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC38.52■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
KIAA0556O60303 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms