Protein–RNA interactions for Protein: O60291

MGRN1, E3 ubiquitin-protein ligase MGRN1, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGRN1O60291 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MGRN1O60291 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MGRN1O60291 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MGRN1O60291 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MGRN1O60291 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MGRN1O60291 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MGRN1O60291 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MGRN1O60291 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGRN1O60291 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGRN1O60291 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGRN1O60291 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
MGRN1O60291 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGRN1O60291 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGRN1O60291 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGRN1O60291 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGRN1O60291 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MGRN1O60291 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGRN1O60291 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MGRN1O60291 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms