Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SH3BP5O60239 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SH3BP5O60239 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SH3BP5O60239 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SH3BP5O60239 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms