Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNA2O43921 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNA2O43921 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNA2O43921 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNA2O43921 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNA2O43921 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNA2O43921 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNA2O43921 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNA2O43921 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA2O43921 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA2O43921 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNA2O43921 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA2O43921 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA2O43921 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA2O43921 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA2O43921 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA2O43921 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA2O43921 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
EFNA2O43921 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
EFNA2O43921 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
EFNA2O43921 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNA2O43921 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
EFNA2O43921 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms