Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP9BO43861 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP9BO43861 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP9BO43861 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms