Protein–RNA interactions for Protein: O43813

LANCL1, LanC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LANCL1O43813 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
LANCL1O43813 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LANCL1O43813 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LANCL1O43813 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms