Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
FOXO3O43524 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
FOXO3O43524 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
FOXO3O43524 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
FOXO3O43524 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
FOXO3O43524 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
FOXO3O43524 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
FOXO3O43524 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.34■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
FOXO3O43524 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FOXO3O43524 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FOXO3O43524 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
FOXO3O43524 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
FOXO3O43524 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
FOXO3O43524 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
FOXO3O43524 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FOXO3O43524 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
FOXO3O43524 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
FOXO3O43524 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
FOXO3O43524 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
FOXO3O43524 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
FOXO3O43524 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
FOXO3O43524 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
FOXO3O43524 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
FOXO3O43524 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
FOXO3O43524 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
FOXO3O43524 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
FOXO3O43524 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
FOXO3O43524 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
FOXO3O43524 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
FOXO3O43524 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
FOXO3O43524 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
FOXO3O43524 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
FOXO3O43524 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.26■■■□□ 2.91
FOXO3O43524 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
FOXO3O43524 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
FOXO3O43524 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
FOXO3O43524 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
FOXO3O43524 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
FOXO3O43524 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
FOXO3O43524 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FOXO3O43524 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
FOXO3O43524 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
FOXO3O43524 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
FOXO3O43524 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
FOXO3O43524 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FOXO3O43524 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FOXO3O43524 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
FOXO3O43524 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
FOXO3O43524 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
FOXO3O43524 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
FOXO3O43524 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
FOXO3O43524 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
FOXO3O43524 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
FOXO3O43524 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
FOXO3O43524 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
FOXO3O43524 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
FOXO3O43524 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
FOXO3O43524 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms