Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRID2O43424 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRID2O43424 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GRID2O43424 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GRID2O43424 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRID2O43424 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRID2O43424 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRID2O43424 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRID2O43424 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRID2O43424 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GRID2O43424 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRID2O43424 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRID2O43424 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRID2O43424 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRID2O43424 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRID2O43424 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRID2O43424 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRID2O43424 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRID2O43424 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRID2O43424 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRID2O43424 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GRID2O43424 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRID2O43424 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRID2O43424 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRID2O43424 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GRID2O43424 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GRID2O43424 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRID2O43424 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRID2O43424 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GRID2O43424 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRID2O43424 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRID2O43424 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRID2O43424 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GRID2O43424 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRID2O43424 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRID2O43424 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRID2O43424 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRID2O43424 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRID2O43424 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GRID2O43424 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRID2O43424 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRID2O43424 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRID2O43424 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRID2O43424 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRID2O43424 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRID2O43424 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRID2O43424 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRID2O43424 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRID2O43424 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRID2O43424 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRID2O43424 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRID2O43424 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRID2O43424 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRID2O43424 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GRID2O43424 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRID2O43424 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRID2O43424 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRID2O43424 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRID2O43424 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRID2O43424 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRID2O43424 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRID2O43424 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRID2O43424 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRID2O43424 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRID2O43424 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRID2O43424 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRID2O43424 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRID2O43424 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRID2O43424 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRID2O43424 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GRID2O43424 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRID2O43424 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRID2O43424 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRID2O43424 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GRID2O43424 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRID2O43424 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRID2O43424 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRID2O43424 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRID2O43424 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRID2O43424 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRID2O43424 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRID2O43424 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRID2O43424 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRID2O43424 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRID2O43424 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRID2O43424 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRID2O43424 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRID2O43424 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRID2O43424 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRID2O43424 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GRID2O43424 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRID2O43424 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GRID2O43424 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
GRID2O43424 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRID2O43424 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRID2O43424 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRID2O43424 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRID2O43424 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRID2O43424 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRID2O43424 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms