Protein–RNA interactions for Protein: O43252

PAPSS1, Bifunctional 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPSS1O43252 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PAPSS1O43252 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PAPSS1O43252 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PAPSS1O43252 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms