Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFS4O43181 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFS4O43181 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFS4O43181 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFS4O43181 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFS4O43181 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFS4O43181 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFS4O43181 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFS4O43181 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFS4O43181 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFS4O43181 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFS4O43181 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFS4O43181 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFS4O43181 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFS4O43181 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFS4O43181 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFS4O43181 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFS4O43181 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFS4O43181 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFS4O43181 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDUFS4O43181 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms