Protein–RNA interactions for Protein: O15245

SLC22A1, Solute carrier family 22 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A1O15245 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC22A1O15245 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC22A1O15245 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC22A1O15245 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms