Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ANKRD28O15084 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ANKRD28O15084 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ANKRD28O15084 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms