Protein–RNA interactions for Protein: O14983

ATP2A1, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A1O14983 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
ATP2A1O14983 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ATP2A1O14983 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP2A1O14983 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
ATP2A1O14983 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2A1O14983 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2A1O14983 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2A1O14983 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2A1O14983 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2A1O14983 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ATP2A1O14983 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2A1O14983 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
ATP2A1O14983 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2A1O14983 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2A1O14983 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2A1O14983 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2A1O14983 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2A1O14983 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
ATP2A1O14983 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2A1O14983 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
ATP2A1O14983 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2A1O14983 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2A1O14983 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ATP2A1O14983 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP2A1O14983 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP2A1O14983 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ATP2A1O14983 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ATP2A1O14983 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP2A1O14983 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP2A1O14983 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ATP2A1O14983 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP2A1O14983 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP2A1O14983 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP2A1O14983 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ATP2A1O14983 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms