Protein–RNA interactions for Protein: O14896

IRF6, Interferon regulatory factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF6O14896 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IRF6O14896 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
IRF6O14896 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IRF6O14896 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRF6O14896 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRF6O14896 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRF6O14896 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
IRF6O14896 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IRF6O14896 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRF6O14896 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRF6O14896 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRF6O14896 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRF6O14896 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRF6O14896 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRF6O14896 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
IRF6O14896 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
IRF6O14896 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
IRF6O14896 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRF6O14896 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRF6O14896 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRF6O14896 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IRF6O14896 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
IRF6O14896 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
IRF6O14896 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
IRF6O14896 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRF6O14896 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IRF6O14896 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IRF6O14896 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
IRF6O14896 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IRF6O14896 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
IRF6O14896 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IRF6O14896 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IRF6O14896 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IRF6O14896 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRF6O14896 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRF6O14896 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRF6O14896 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRF6O14896 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRF6O14896 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IRF6O14896 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRF6O14896 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRF6O14896 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IRF6O14896 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRF6O14896 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRF6O14896 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRF6O14896 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRF6O14896 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRF6O14896 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRF6O14896 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRF6O14896 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRF6O14896 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRF6O14896 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IRF6O14896 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRF6O14896 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRF6O14896 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IRF6O14896 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRF6O14896 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRF6O14896 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRF6O14896 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRF6O14896 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRF6O14896 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IRF6O14896 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRF6O14896 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRF6O14896 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRF6O14896 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRF6O14896 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IRF6O14896 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
IRF6O14896 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
IRF6O14896 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IRF6O14896 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRF6O14896 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IRF6O14896 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
IRF6O14896 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
IRF6O14896 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRF6O14896 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRF6O14896 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRF6O14896 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IRF6O14896 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
IRF6O14896 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
IRF6O14896 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRF6O14896 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRF6O14896 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRF6O14896 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
IRF6O14896 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRF6O14896 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRF6O14896 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRF6O14896 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRF6O14896 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRF6O14896 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRF6O14896 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
IRF6O14896 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRF6O14896 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRF6O14896 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRF6O14896 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRF6O14896 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRF6O14896 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRF6O14896 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IRF6O14896 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRF6O14896 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IRF6O14896 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms