Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
RGPD8O14715 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
RGPD8O14715 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
RGPD8O14715 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
RGPD8O14715 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RGPD8O14715 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
RGPD8O14715 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RGPD8O14715 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RGPD8O14715 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
RGPD8O14715 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
RGPD8O14715 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
RGPD8O14715 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
RGPD8O14715 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
RGPD8O14715 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
RGPD8O14715 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RGPD8O14715 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
RGPD8O14715 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
RGPD8O14715 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RGPD8O14715 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.46■■■□□ 2.95
RGPD8O14715 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RGPD8O14715 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
RGPD8O14715 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RGPD8O14715 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RGPD8O14715 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
RGPD8O14715 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
RGPD8O14715 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RGPD8O14715 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RGPD8O14715 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RGPD8O14715 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RGPD8O14715 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
RGPD8O14715 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RGPD8O14715 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
RGPD8O14715 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
RGPD8O14715 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD8O14715 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD8O14715 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD8O14715 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD8O14715 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
RGPD8O14715 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RGPD8O14715 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
RGPD8O14715 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
RGPD8O14715 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
RGPD8O14715 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RGPD8O14715 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RGPD8O14715 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RGPD8O14715 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
RGPD8O14715 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
RGPD8O14715 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC33.37■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
RGPD8O14715 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RGPD8O14715 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RGPD8O14715 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RGPD8O14715 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RGPD8O14715 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RGPD8O14715 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RGPD8O14715 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RGPD8O14715 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
RGPD8O14715 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RGPD8O14715 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RGPD8O14715 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RGPD8O14715 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RGPD8O14715 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
RGPD8O14715 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RGPD8O14715 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RGPD8O14715 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RGPD8O14715 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
RGPD8O14715 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
RGPD8O14715 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms