Protein–RNA interactions for Protein: O14593

RFXANK, DNA-binding protein RFXANK, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXANKO14593 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFXANKO14593 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFXANKO14593 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFXANKO14593 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFXANKO14593 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RFXANKO14593 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFXANKO14593 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RFXANKO14593 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFXANKO14593 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFXANKO14593 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFXANKO14593 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFXANKO14593 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RFXANKO14593 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFXANKO14593 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RFXANKO14593 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RFXANKO14593 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFXANKO14593 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFXANKO14593 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RFXANKO14593 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFXANKO14593 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFXANKO14593 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFXANKO14593 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFXANKO14593 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFXANKO14593 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RFXANKO14593 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RFXANKO14593 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RFXANKO14593 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms