Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTPRTO14522 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTPRTO14522 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PTPRTO14522 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
PTPRTO14522 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PTPRTO14522 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
PTPRTO14522 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PTPRTO14522 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
PTPRTO14522 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PTPRTO14522 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PTPRTO14522 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
PTPRTO14522 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
PTPRTO14522 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
PTPRTO14522 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PTPRTO14522 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
PTPRTO14522 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTPRTO14522 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
PTPRTO14522 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
PTPRTO14522 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PTPRTO14522 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
PTPRTO14522 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PTPRTO14522 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PTPRTO14522 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
PTPRTO14522 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
PTPRTO14522 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
PTPRTO14522 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
PTPRTO14522 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PTPRTO14522 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
PTPRTO14522 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRTO14522 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRTO14522 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRTO14522 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
PTPRTO14522 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
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