Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
BHLHE40O14503 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
BHLHE40O14503 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BHLHE40O14503 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms