Protein–RNA interactions for Protein: O00534

VWA5A, von Willebrand factor A domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5AO00534 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWA5AO00534 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWA5AO00534 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWA5AO00534 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWA5AO00534 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
VWA5AO00534 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
VWA5AO00534 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
VWA5AO00534 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VWA5AO00534 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VWA5AO00534 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VWA5AO00534 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VWA5AO00534 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
VWA5AO00534 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VWA5AO00534 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
VWA5AO00534 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
VWA5AO00534 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VWA5AO00534 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VWA5AO00534 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VWA5AO00534 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VWA5AO00534 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
VWA5AO00534 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
VWA5AO00534 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VWA5AO00534 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VWA5AO00534 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
VWA5AO00534 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
VWA5AO00534 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
VWA5AO00534 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
VWA5AO00534 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VWA5AO00534 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
VWA5AO00534 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
VWA5AO00534 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
VWA5AO00534 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
VWA5AO00534 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
VWA5AO00534 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
VWA5AO00534 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
VWA5AO00534 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
VWA5AO00534 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
VWA5AO00534 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VWA5AO00534 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VWA5AO00534 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VWA5AO00534 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
VWA5AO00534 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
VWA5AO00534 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VWA5AO00534 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VWA5AO00534 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
VWA5AO00534 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
VWA5AO00534 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWA5AO00534 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWA5AO00534 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWA5AO00534 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWA5AO00534 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
VWA5AO00534 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
VWA5AO00534 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
VWA5AO00534 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VWA5AO00534 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
VWA5AO00534 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VWA5AO00534 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
VWA5AO00534 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
VWA5AO00534 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
VWA5AO00534 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
VWA5AO00534 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
VWA5AO00534 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
VWA5AO00534 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
VWA5AO00534 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms