Protein–RNA interactions for Protein: O00469

PLOD2, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD2O00469 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PLOD2O00469 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PLOD2O00469 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PLOD2O00469 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms