Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GOLIM4O00461 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GOLIM4O00461 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GOLIM4O00461 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms