Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
AGPSO00116 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGPSO00116 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
AGPSO00116 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGPSO00116 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGPSO00116 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGPSO00116 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGPSO00116 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGPSO00116 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGPSO00116 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGPSO00116 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
AGPSO00116 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
AGPSO00116 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
AGPSO00116 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGPSO00116 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGPSO00116 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGPSO00116 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AGPSO00116 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGPSO00116 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGPSO00116 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGPSO00116 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGPSO00116 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGPSO00116 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
AGPSO00116 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
AGPSO00116 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGPSO00116 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGPSO00116 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGPSO00116 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGPSO00116 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGPSO00116 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
AGPSO00116 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGPSO00116 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGPSO00116 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGPSO00116 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGPSO00116 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
AGPSO00116 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGPSO00116 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGPSO00116 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGPSO00116 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGPSO00116 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
AGPSO00116 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
AGPSO00116 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGPSO00116 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
AGPSO00116 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGPSO00116 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGPSO00116 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
AGPSO00116 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGPSO00116 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
AGPSO00116 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGPSO00116 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGPSO00116 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGPSO00116 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGPSO00116 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGPSO00116 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AGPSO00116 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGPSO00116 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AGPSO00116 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPSO00116 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPSO00116 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPSO00116 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPSO00116 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPSO00116 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPSO00116 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPSO00116 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPSO00116 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPSO00116 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPSO00116 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPSO00116 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPSO00116 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPSO00116 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AGPSO00116 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGPSO00116 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGPSO00116 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGPSO00116 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGPSO00116 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGPSO00116 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AGPSO00116 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGPSO00116 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AGPSO00116 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGPSO00116 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGPSO00116 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGPSO00116 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGPSO00116 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AGPSO00116 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AGPSO00116 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AGPSO00116 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
AGPSO00116 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AGPSO00116 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGPSO00116 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGPSO00116 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGPSO00116 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGPSO00116 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGPSO00116 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGPSO00116 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGPSO00116 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGPSO00116 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGPSO00116 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGPSO00116 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGPSO00116 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
AGPSO00116 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms