Protein–RNA interactions for Protein: H3BRB1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BRB1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BRB1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BRB1 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BRB1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BRB1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BRB1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
H3BRB1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
H3BRB1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
H3BRB1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
H3BRB1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
H3BRB1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H3BRB1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
H3BRB1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H3BRB1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
H3BRB1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
H3BRB1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
H3BRB1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
H3BRB1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H3BRB1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
H3BRB1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H3BRB1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
H3BRB1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
H3BRB1 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
H3BRB1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
H3BRB1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
H3BRB1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
H3BRB1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
H3BRB1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
H3BRB1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
H3BRB1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
H3BRB1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
H3BRB1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
H3BRB1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
H3BRB1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
H3BRB1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
H3BRB1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
H3BRB1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
H3BRB1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
H3BRB1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
H3BRB1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
H3BRB1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
H3BRB1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H3BRB1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
H3BRB1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
H3BRB1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
H3BRB1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
H3BRB1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
H3BRB1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
H3BRB1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
H3BRB1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
H3BRB1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
H3BRB1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
H3BRB1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
H3BRB1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
H3BRB1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
H3BRB1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
H3BRB1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
H3BRB1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
H3BRB1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BRB1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BRB1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BRB1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BRB1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BRB1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BRB1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BRB1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BRB1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
H3BRB1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
H3BRB1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
H3BRB1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
H3BRB1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
H3BRB1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
H3BRB1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H3BRB1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H3BRB1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H3BRB1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H3BRB1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
H3BRB1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H3BRB1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H3BRB1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
H3BRB1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H3BRB1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H3BRB1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H3BRB1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
H3BRB1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
H3BRB1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
H3BRB1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
H3BRB1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
H3BRB1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
H3BRB1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H3BRB1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
H3BRB1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
H3BRB1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
H3BRB1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
H3BRB1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
H3BRB1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
H3BRB1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
H3BRB1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
H3BRB1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
H3BRB1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms