Protein–RNA interactions for Protein: H3BQF6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BQF6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BQF6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
H3BQF6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQF6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQF6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQF6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQF6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQF6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQF6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQF6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQF6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQF6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQF6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQF6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
H3BQF6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQF6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQF6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQF6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQF6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQF6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQF6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQF6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H3BQF6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQF6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQF6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQF6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQF6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQF6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQF6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQF6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQF6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQF6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQF6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQF6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
H3BQF6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BQF6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BQF6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BQF6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BQF6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BQF6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BQF6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BQF6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BQF6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BQF6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BQF6 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H3BQF6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BQF6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BQF6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BQF6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
H3BQF6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQF6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQF6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQF6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQF6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQF6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQF6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQF6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQF6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H3BQF6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BQF6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BQF6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BQF6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BQF6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BQF6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
H3BQF6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BQF6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BQF6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BQF6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BQF6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BQF6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H3BQF6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQF6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQF6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQF6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQF6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQF6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQF6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQF6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQF6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQF6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
H3BQF6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
H3BQF6 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
H3BQF6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
H3BQF6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQF6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQF6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQF6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQF6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQF6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H3BQF6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQF6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQF6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQF6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQF6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H3BQF6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BQF6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BQF6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BQF6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
H3BQF6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H3BQF6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms