Protein–RNA interactions for Protein: H3BNX3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNX3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNX3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNX3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNX3 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNX3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BNX3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BNX3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BNX3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BNX3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BNX3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BNX3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BNX3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BNX3 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BNX3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BNX3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BNX3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BNX3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BNX3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BNX3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BNX3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BNX3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BNX3 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BNX3 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BNX3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BNX3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BNX3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BNX3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BNX3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BNX3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BNX3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BNX3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BNX3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BNX3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BNX3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BNX3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BNX3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BNX3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BNX3 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
H3BNX3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BNX3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BNX3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BNX3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BNX3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BNX3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BNX3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BNX3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BNX3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BNX3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BNX3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BNX3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
H3BNX3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BNX3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BNX3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BNX3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BNX3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BNX3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BNX3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BNX3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BNX3 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
H3BNX3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BNX3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BNX3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BNX3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BNX3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BNX3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BNX3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BNX3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
H3BNX3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BNX3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BNX3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BNX3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BNX3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BNX3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BNX3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BNX3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BNX3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
H3BNX3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BNX3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BNX3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BNX3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BNX3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BNX3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BNX3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BNX3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
H3BNX3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BNX3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BNX3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BNX3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BNX3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BNX3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BNX3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BNX3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BNX3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
H3BNX3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H3BNX3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
H3BNX3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
H3BNX3 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BNX3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BNX3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H3BNX3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms