Protein–RNA interactions for Protein: H3BNH8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNH8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BNH8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BNH8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BNH8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BNH8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BNH8 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BNH8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H3BNH8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BNH8 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BNH8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BNH8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BNH8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BNH8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BNH8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BNH8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BNH8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
H3BNH8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BNH8 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BNH8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BNH8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H3BNH8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BNH8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BNH8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BNH8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BNH8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BNH8 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BNH8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BNH8 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BNH8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BNH8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
H3BNH8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BNH8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BNH8 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BNH8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BNH8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BNH8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
H3BNH8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BNH8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BNH8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BNH8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BNH8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BNH8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BNH8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BNH8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
H3BNH8 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
H3BNH8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
H3BNH8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BNH8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BNH8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BNH8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BNH8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BNH8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BNH8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BNH8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
H3BNH8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNH8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNH8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNH8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNH8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNH8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNH8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNH8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNH8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNH8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNH8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNH8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNH8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNH8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNH8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNH8 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNH8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
H3BNH8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BNH8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BNH8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BNH8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BNH8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BNH8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BNH8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
H3BNH8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BNH8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BNH8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
H3BNH8 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BNH8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BNH8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BNH8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
H3BNH8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BNH8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BNH8 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BNH8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BNH8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BNH8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BNH8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
H3BNH8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H3BNH8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H3BNH8 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
H3BNH8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BNH8 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BNH8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BNH8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
H3BNH8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms