Protein–RNA interactions for Protein: E9PQR5

NPIPB8, Nuclear pore complex-interacting protein family member B8, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB8E9PQR5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NPIPB8E9PQR5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NPIPB8E9PQR5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NPIPB8E9PQR5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NPIPB8E9PQR5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms