Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
USP17L11C9JVI0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
USP17L11C9JVI0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP17L11C9JVI0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
USP17L11C9JVI0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms